福建中醫藥大學創建于1958年，是我國創辦較早的高等中醫藥院校之一，兩次入選福建省重點建設高校，是福建省“雙一流”建設高校，是福建省人民政府、國家中醫藥管理局共建高校。

學校設有13個學院（部），2個研究院；有中醫學、中西醫結合2個博士后科研流動站；有中醫學、中西醫結合、中藥學和中醫博士專業學位4個博士學位授權點，有中醫學、中西醫結合、臨床醫學、藥學、中藥學、護理學等6個碩士學位授權一級學科，有中醫、中藥、針灸、護理、醫學技術、臨床醫學、公共管理等7個碩士專業學位類別；有中醫學、中醫骨傷科學、針灸推拿學、中西醫臨床醫學、臨床醫學、藥學、中藥學、藥物制劑、制藥工程、護理學、公共事業管理、醫學影像技術、食品科學與工程、康復治療學、信息管理與信息系統、健康服務與管理、聽力與言語康復學、康復物理治療、康復作業治療等19個本科專業。現有全日制在校生近1.5萬人，其中研究生2900多人。

學校現有教職醫護員工（含4所直屬附屬醫院）6000多人，其中具有高級職稱的專業技術人員1000多人；擁有1名中國科學院院士（雙聘教授）、1名國際歐亞科學院院士、3名國醫大師、5名全國名中醫、3名國家中醫藥傳承與創新“百千萬”人才工程（岐黃工程）岐黃學者、4名青年岐黃學者、2名“全國中醫藥杰出貢獻獎”獲得者、6名教育部教學指導委員會委員（其中中醫學類專業教學指導委員會副主任委員1名、中西醫結合類專業教學指導委員會副主任委員1名），1名國家“萬人計劃”青年拔尖人才；擁有一批“百千萬”人才工程國家級人選、國家和衛生部有突出貢獻的中青年專家、國務院特殊津貼專家、國家級名老中醫學術繼承人指導老師、全國百名杰出青年中醫、全國優秀教師、全國模范教師等，1支團隊入選“全國高校黃大年式教師團隊”。

2002年和2007年，學校先后兩次在教育部組織的本科教學工作水平評估中獲得“優秀”。2010年12月，中醫學通過教育部試點專業認證。2016年，學校順利通過本科教學工作審核評估，康復物理治療、康復作業治療分別通過世界物理治療聯盟、世界作業治療聯盟國際教育標準認證。2017年5月，中藥學通過教育部專業認證。2019年3月，護理學通過教育部專業認證。2020年3月，臨床醫學通過教育部專業認證。目前，學校擁有9個國家級一流本科專業建設點、4個國家級特色專業、1個國家級專業綜合改革試點、2項國家級卓越醫生（中醫）教育培養計劃改革試點項目、1個國家級大學生校外實踐教育基地、1個國家級人才培養模式創新實驗區、1個國家中醫臨床教學培訓示范中心、10門國家級一流本科課程、2個國家級課程思政示范項目、3門國家級精品課程、2門國家級精品視頻公開課、3門國家級精品資源共享課、1門國家級雙語教學示范課程、2個國家級教學團隊，1個國家級首批虛擬教研室建設試點。主編“十二五”“十三五”“十四五”規劃教材97部。獲教學成果獎國家級一等獎1項、二等獎3項，省級特等獎7項、一等獎19項、二等獎21項。獲教師教學類競賽省級及以上特等獎5項、一等獎48項、二等獎57項、三等獎50項，其中國家級一等獎2項、二等獎5項、三等獎5項。

學校有11個國家中醫藥管理局“十一五”中醫藥重點學科，9個國家中醫藥管理局“十二五”中醫藥重點學科，8個國家中醫藥管理局高水平中醫藥重點學科建設項目，中醫學、中西醫結合2個學科入選福建省第二輪“雙一流”建設主干學科，中西醫結合學科入選福建省普通高等學校一流學科培優計劃建設學科，5個學科入選省中醫藥重點學科建設項目。ESI臨床醫學學科、ESI藥理學與毒理學學科進入全球排名前1%行列。有2個國家發展和改革委員會國家地方聯合工程研究中心，1個教育部重點實驗室，1個教育部省部共建協同創新中心，1個國家中醫藥管理局中醫康復研究中心，3個國家中醫藥管理局重點研究室，8個國家中醫藥管理局三級科研實驗室，1個國家中醫藥管理局中醫藥文獻檢索中心，4個省級協同創新中心，9個省級重點實驗室，3個省級工程（技術）研究中心，7個省級臨床醫學研究中心，2個省級大數據研究所，3個省級產教融合研究生聯合培養基地，1個閩澳科技合作基地，4個省科協優秀科普教育基地，14個省級各類實驗室、基地及中心。我校先后有859項科研成果受到國家和省市等各級獎勵，其中國家科學技術進步二等獎1項，教育部科學技術進步獎（科普類）二等獎1項。2018年以來，學校進一步推進科技創新，加大科研投入，共承擔科研課題近4000余項，其中國家級項目200多項，實現了國家科技部重點研發計劃項目、國家科技部重大新藥創制項目、國家自然科學基金重點項目、國家自然科學基金區域聯合基金項目及國家社會科學基金的突破。

學校有4所直屬附屬醫院，其中附屬人民醫院是國家中醫臨床研究基地、國家中醫藥傳承創新中心，附屬第二人民醫院是國家中醫藥傳承創新工程重點中醫醫院，附屬第三人民醫院是國家級中醫藥高層次人才培養基地，附屬康復醫院是通過國際康復質量認證委員會（CARF）認證的康復專科醫院；有11所非直屬附屬醫院、9所臨床醫學院，各類教學及畢業實習基地逾百所。有康復、肛腸、脾胃、外科等8個國家臨床重點專科，17個國家中醫藥管理局重點專科、專病，15個國家中醫優勢專科。學校設立國醫堂，為社會提供服務。

學校擁有兩個校區，共占地1030畝，各類建筑總面積36萬多平方米，教學科研儀器設備總值5.91億多元，紙質圖書154.9萬多冊、電子圖書140萬冊。學校各類設施優良，配備了現代化的教學、科研、行政、生活等設施，建設了富有中醫藥文化氣息的人文景觀，被授予“全國中醫藥文化建設先進單位”“全國綠化模范單位”榮譽稱號，已連續七次被福建省委、福建省人民政府授予“文明學校”榮譽稱號，連續兩屆被授予福建省“文明校園”榮譽稱號。學校被確定為全國第一批“節約型公共機構示范單位”創建單位，獲全國“公共機構能效領跑者”榮譽稱號，入選首批全國節水型高校典型案例。

學校是內地第一所招收臺灣學生、最早一批招收外國留學生的中醫藥院校，現已形成博士、碩士、學士、短期進修等多層次、多規格、多形式的對外對臺港澳教育格局，在美國、澳大利亞、東南亞及臺港澳地區的校友已成為當地中醫藥界的骨干力量；與30多個國家和地區的百余所高等院校、科研醫療機構和學術團體建立了交流合作關系；學校率先建立了福建省第一個海外中醫藥中心——“中國—菲律賓中醫藥中心”；獲批福建省醫學類相關專業首個中外合作辦學項目——護理學專業中外合作辦學項目；持續打造對外對臺交流活動品牌項目，舉辦了十六屆“海峽兩岸中醫藥學術交流研討會”、十五屆“海峽兩岸中醫藥傳統文化研習營”、4期“‘海絲’中醫健康大講壇”。

在新的發展階段，學校以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，秉承“大醫精誠，止于至善”的校訓精神，進一步傳承精華，守正創新，努力把學校建設成為一所以中醫藥為主體，多學科協調發展的高水平、有特色的一流中醫藥大學。（以上數據截止于2024年12月）