南京醫科大學是國家“雙一流”建設高校，首批教育部、國家衛生健康委與江蘇省人民政府共建醫學院校，教育部高水平公共衛生學院建設高校，江蘇高水平大學建設高峰計劃A類建設高校。學校創建于1934年，時名江蘇省立醫政學院，抗戰時期更名為國立江蘇醫學院。1957年，由鎮江遷至南京，更名為南京醫學院。1962年，被列為全國首批六年制醫藥院校。1981年，被批準為全國首批博士、碩士學位授予單位。1993年，更名為南京醫科大學。

學校建有江寧校區和五臺校區，校本部有教職工1900多人。學校現有中國工程院、科學院院士7人（含工作站），美國國家醫學院外籍院士1人，中國醫學科學院學部委員2人，國家級高層次人才100余人次。學校擁有國家級教學團隊6個，其中，入選“全國高校黃大年式教師團隊”2個；有國家級課程思政示范團隊1個，教育部“創新團隊”1個，國家創新研究群體3個。

學校現有一級學科博士學位授權點8個、二級學科博士學位授權點54個、交叉學科博士學位授權點5個、專業博士學位授權點2個；一級學科碩士學位授權點11個、二級學科碩士學位授權點65個；博士后科研流動站6個，學位授權點覆蓋醫學、理學、工學、管理學、法學、教育學和文學7個學科門類；擁有國家重點學科3個、國家重點（培育）學科1個、國家臨床重點專科29個、江蘇高校優勢學科（三期）6個。在新一輪全國學科評估中整體實力穩中有進；12個學科位列ESI全球排名前1%，其中，臨床醫學學科、藥理學與毒理學學科位列ESI全球排名前1‰。

學校設有19個學院（含一個獨立設置二級學院），擁有25個本科專業，3個本碩博貫通培養專業方向、3個“5+3”本碩一體化專業方向，在校學生總數近2萬人。學校入選教育部基礎學科拔尖學生培養計劃2.0基地，國家級一流本科專業建設點占全校專業總數近八成，建有一大批國家級教學平臺和課程資源。學校招生、培養和就業工作廣受社會各界好評，畢業生執業醫師資格考試通過率位居國內同類院校前列，畢業生就業率始終保持在96%以上。

學校建有生殖醫學與子代健康全國重點實驗室、環境與人類健康國際聯合研究中心、腫瘤個體化醫學省部共建協同創新中心等30多個國家級、省部級重點實驗室（工程研究中心、創新中心）。擁有國內一流的醫學模擬教育中心和江蘇省醫藥動物實驗基地，建有省內唯一的省級衛生政策智庫—江蘇省健康研究院。“十三五”以來，承擔國家重點研發計劃項目(課題)，國家自然科學基金重點、重大項目，創新研究群體項目等國家級重大科研項目近百項，產生了以國家自然科學二等獎為代表的一批國家級和省部級獎項，科研成果在《自然》《科學》等頂級期刊發表。

學校堅持“開門辦學”，與各級政府，國內外高等院校、科研機構、社會團體等建立了形式多樣的聯系與合作。學校先后與美國、俄羅斯、加拿大、澳大利亞、瑞典、日本等國家和香港、澳門、臺灣地區的醫學院校或科研機構建立了良好的戰略合作和學術交流關系。

“十四五”期間，學校堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指引，聚焦一流學科、一流附屬醫院和一流辦學條件，凝心聚力、統籌施策、開拓創新、改革攻堅，努力建成國內一流、國際知名的高水平研究型醫科大學。